Suivant le Décret n° 98-290 du 02 avril 1998, l'INSTAT a été institué sous le statut d'Établissement Public à caractère Industriel et Commercial (EPIC) le 21 avril 1998. Étant donné son rôle primordial pour le développement de Madagascar, cet Office devra orienter ses travaux :

(i) en tant que service public : à l’élaboration des données officielles sur les statistiques minimums pour les analyses socio-économiques (les indices des prix, les comptes nationaux, le cadrage macro-économique, les indices de développement humain) et le profil social.

(ii) en tant que prestataire de service : à la réalisation d'enquêtes de suivi du niveau de vie et études socio-économiques et démographiques (les enquêtes, le traitement et l’analyse), à la gestion de base de données (saisie, contrôle etc.) ainsi qu'au développement informatique.